Circa un milione e mezzo di anni fa si sono susseguite almeno cinque vaste glaciazioni, che hanno contribuito in maniera determinante a modella il paesaggio. Gli enormi ghiacciai diedero origine alle grandi lingue vallive che sfociarono in pianura. All loro ritiro rimasero valli ad U, bacini lacustri, hugei apparati morenici e conoidi post-alluvionali dai quali ebbero origine i laghi alpini, come per esempio il lago di Garda e di Como. La sequenza più spettacolare di Ghiacciai nel Parco Nazionale si trova al Passo Stelvio vicino all'Hotel Franzenshöhe. Le enormi masse di neve e ghiaccio costituiscono una preziosa riserva d'acqua che alimenta centinaia di Sorgenti, ruscelli scroscianti, laghi immobili e silenziosi, fragorose cascate.